縦横比率は【1:2】

緑は農業、黄色は太陽と主要産物のカカオ、赤は独立闘争で流された血、黒い２つの星はサントメ島とプリンシペ島を表します。

独立運動本格化の要因となった、サントメ・プリンシペ独立運動党の結成、そこで使われた旗が現在の国旗のモデルとなっています。